In der Landwirtschaft werden transgene Nutzpflanzen vor allem eingesetzt, um ihnen bestimmte erwünschte Eigenschaften zu verleihen. Dazu gehören beispielsweise Mais- und Baumwollpflanzen, die gegen bestimmte Schadinsekten geschützt sind (siehe auch Bt-Mais), sowie Soja- und andere Nutzpflanzen, die bestimmte Unkrautbekämpfungsmittel vertragen. Auch die Zusammensetzung von Inhaltsstoffen, etwa der Gehalt bestimmter Nährstoffe,