Der Andenstaat ist administrativ in neun Departamentos und nachfolgend in 112 Provinzen und 311 Gemeinden (Municipios) gegliedert. Die Departamentos werden jeweils von einem (gewählten) Präfekten verwaltet. In der Verfassung von 2009 wird den indigenen Gemeinschaften auf ihrem traditionellen Territorium das Recht auf Selbstverwaltung zugesprochen.