Substrate wie Silage, Gülle oder Bioabfälle werden zerkleinert und in den Biogasanlagen unter Luftabschluss durch Bakterien abgebaut. Bei dieser Vergärung wird der Kohlenstoff, der in den Substraten in Form von Proteinen, Fetten und Zuckern gebunden ist, in mehreren Phasen zu Biogas umgesetzt. Mikroorganismen spalten die Proteine, Fette und Polysaccharide (Vielfachzucker)