Infolge der Kriege weist das Bildungswesen gravierende Mängel auf. Das Schulwesen gliedert sich in eine achtjährige Primarstufe (Schulpflicht) und eine dreijährige Sekundarstufe. Neben der Universität in Dschuba (gegründet 1977) gibt es mehrere kleine staatliche und private Hochschulen.