Entlang der Küsten sind mehrere Schildkröten- und Eidechsenarten, Geckos und Schlangen anzutreffen. Die in der Adria lebenden Robben und adriatischen Delfine sind vom Aussterben bedroht. In Mitteleuropa seltenere Vögel wie Schwarzstörche, Zwergseeschwalbe und Bienenfresser sind in Kroatien heimisch. In den Gebirgen haben unter anderem Wölfe, Braunbären, Luchse und Goldschakale ihre