Sich wiederholende Genabschnitte in Bakterien-DNA wurden erstmals Ende der 1980er-Jahre beschrieben. Die Bezeichnung CRISPR ist seit etwa 2002 gebräuchlich. Den Molekularbiologinnen und Nobelpreisträgerinnen Emmanuelle Charpentier (* 1968) und Jennifer A. Doudna (* 1964) ist es 2011/2012 gelungen, den Komplex aus crRNA und tracrRNA künstlich herzustellen und ihm Spezifität zum Erkennen ganz