Am häufigsten sind mediterrane Pflanzengemeinschaften vertreten. Um Beerscheba tritt eine niedrige Buschvegetation mit Zwergsträuchern (u. a. Wermut) auf. Im Negev und im südlichen Jordangraben herrscht Wüstenvegetation. Eine eigenständige und sehr artenreiche Vegetationsgemeinschaft kennzeichnet die wärme- und süßwasserreiche Hulaebene.