Mitochondrien sind von zwei Membranen umhüllt, von denen die innere stark eingefältet ist. Dies erhöht ihre Oberfläche auch auf sehr kleinem Raum. Hier findet der Prozess der Atmungskette statt. Das Innere der Mitochondrien, die Matrix, enthält die Enzyme des Fettsäureabbaus und des Zitronensäurezyklus.