Charakterisierung von Mikroorganismen anhand ihrer chromosomalen DNA, ihrer Plasmide oder anderer genetischer Elemente. Der Genotyp dient v. a. der Identifizierung von Infektionserregern sowie dem Nachweis ihrer Herkunft (Aufklärung der Infektkette). Mit der Genotypisierung erhält man einen Fingerabdruck des Infektionserregers und kann ihn somit besser bekämpfen. Man unterscheidet verschiedene molekularbiologische Methoden,