Bei den Pflanzen verläuft die Atmung (hier auch als Dissimilationbezeichnet) neben der Assimilation, besonders der lichtabhängigen Kohlenstoffassimilation (Fotosynthese); sie ist formal deren Umkehrung und findet in allen (auch den chlorophyllfreien) Zellen ununterbrochen, also auch nachts statt. Bei der äußeren Atmung erfolgt die O₂-Zufuhr und CO₂-Abgabe in Hohlraumsystemen (Interzellularen)