Klimaforscher rätseln zurzeit noch, wie der Klimawandel das Phänomen El Niño beeinflussen könnte. Einige Vermutungen lauten, die durch den Klimawandel steigenden Temperaturen könnten zu einer Art Dauer-El-Niño mit sehr seltener Rückkehr zum Normalzustand oder sogar zu La Niña führen. Ob das aber wirklich eintritt, ist noch unklar.