Seine Schrift »Neues Werkzeug der Wissenschaften« (Original: »Novum organum scientiarum«) aus dem Jahr 1620 gilt als sein philosophisches und wissenschaftstheoretisches Hauptwerk. Ursprünglich wollte Bacon ein mehrteiliges Werk verfassen, in dem die geplante umfassende Neuerung dargelegt werden sollte. Er führte aber nicht alle vorgesehenen Teile aus.