Die ursprüngliche Struktur der ZWO wurde 1921, 1960 und 1968 reformiert. Anfang des 21. Jahrhunderts sind mit ihr nationale zionistische Zusammenschlüsse in über 40 Ländern verbunden. Als Legislative dienen die Zionistischen Weltkongresse (XXXVIII. in Jerusalem 2020). Der vom ZWK gewählte Präsident vertritt die Gesamtorganisation. Das Congress Tribunal ist für Rechtswesen zuständig,