Der Kanton Thurgau gliedert sich (getrennt durch mehrere Senken) in den südlich des Bodensees gelegenen Molassehügelzug des Seerückens, das stark gekammerte thurgauische Hügelland und die Nagelfluhberge des nördlichen Tössberglandes. Hauptfluss ist die Thur, die den Kanton von Osten nach Westen durchfließt. Höchster Punkt des Kantons ist der Hohgrat mit 991