Eine weitere Methode zur Gewinnung pluripotenter adulter Stammzellen ist die Reprogrammierung. Dabei werden Körperzellen erwachsener Menschen in eine Art embryonalen Zustand zurückversetzt. 2006 konnte die Forschergruppe um K. Takahashi und S. Yamanaka mithilfe von Transkriptionsfaktoren (Oct3/4, Sox2, c-Myc und Klf4) eine Umprogrammierung von Maus-Fibroblasten (Hautzellen) in pluripotente Stammzellen erzielen.