Das Verkehrsnetz ist radial um den Kantonshauptort Schaffhausen angelegt. Direkte Bahnlinien führen nach Zürich, Winterthur und Stein am Rhein. Eine Linie der Deutschen Bahn durchquert den Kanton in Ost-West-Richtung (Verbindung Basel−Singen, Deutschland), die Autobahn A 4 von Norden nach Süden. Die Schifffahrt auf dem Rhein dient touristischen Zwecken.