An der Spitze der Gerichtsorganisation steht der Oberste Gerichtshof, der aus einem leitenden Richter und weiteren 14 Richtern besteht. Ihm nachgeordnet sind der Appellationsgerichtshof, Regionalgerichte und Munizipal- beziehungsweise Stadtgerichte. Daneben existiert ein Gerichtshof für Korruptions- und Amtsmissbrauchsfälle (Sandiganbayan) und ein Gerichtshof für Berufungen in Steuersachen. In einigen Provinzen auf Mindanao,