Unter den verschiedenen Methoden, die in der kombinatorischen Chemie angewendet werden, ist die automatisierte Trenn- und Mischsynthese (Split-and-mix-Verfahren) eine der wichtigsten. Unterschiedliche chemische Grundbausteine (im Bild: A_1–3) werden vorzugsweise in verschiedenen Reaktionsgefäßen an eine größere Anzahl von Trägermaterialien (z. B. Polymerkügelchen) geknüpft und bilden den Ausgangspunkt der kombinierten Synthese (Bild).