Gesamtheit der in einem einzelnen Zelltyp oder Gewebe vorhandenen RNA-Moleküle (Transkripte). Da in verschiedenen Zellen jeweils unterschiedliche Gene aktiv sind und diese Transkription außerdem einer Kontrolle durch Umweltfaktoren oder hormonelle Signale unterliegt, ist das Transkriptom dynamisch. Die Analyse des Transkriptoms beinhaltet die Bestimmung von Art und Menge der RNA-Arten bestimmter