Burundi liegt in den wechselfeuchten Tropen und hat zwei Regenzeiten (September–Dezember, Februar–Mai). Die Temperaturen, allgemein durch die Höhenlage gemildert, erreichen nur in der etwa 800 m über dem Meeresspiegel gelegenen Grabensenke am Tanganjikasee und am Fluss Rusisi hohe Werte (jährlicher Mittelwert: fast 24 °C).