Walther war ab 1702 Organist in Erfurt, ab 1707 Stadtorganist in Weimar und Musiklehrer des Prinzen Johann Ernst von Sachsen-Weimar (* 1696, † 1715). Mit J. S. Bach stand er bis zu dessen Weggang aus Weimar (1717) in enger persönlicher und musikalischer Verbindung. Walther komponierte fast ausschließlich für Tasteninstrumente, v. a.