Prescott war Professor an der Carnegie Mellon University in Pittsburgh (Pennsylvania, 1975–80), der University of Minnesota (1980–98, 1999–2003), der University of Chicago (1998–99) und (ab 2003) an der Arizona State University in Tempe. Der Berater der Federal Reserve Bank von Minneapolis (Minnesota, ab 1980) beschäftigte sich hauptsächlich mit Konjunkturtheorie, Entwicklungsökonomik,