Die 135 km voneinander entfernt liegenden Inseln gehören zur Vulkankette der »Kamerunlinie«. Im Südwesten des Landes steigen mehrere Hundert Meter hohe und dicht bewachsene Vulkanschlote (Phonolithschlote; hier »duque« genannt) auf. Fast die Hälfte der Insel São Tomé (859 km²) wird von einem Bergmassiv mit dem höchsten Gipfel des Landes