Der Ort war seit dem Ausgang der Jungsteinzeit bewohnt, seit der frühen Bronzezeit befestigt. Im frühen 2. Jahrtausend v. Chr. befand sich in Alişar Hüyük eine Kolonie assyrischer Kaufleute; Siedlungslücke zwischen 1700 und 1300 v. Chr., dann hethitischer Ort, danach noch von Phrygiern bewohnt.