Das Kantonsgebiet liegt im Plateau- und Kettenjura und umfasst neben den verkarsteten Hügellandschaften der Freiberge und der Ajoie (Ausläufer von Porrentruy) das innerjurassische Becken von Delémont, das von der Birs gequert wird, sowie den Clos du Doubs, der von einer großen, canyonartig eingetieften Schlinge des Doubs umschlossen wird. Die tiefstgelegene