Im Bereich der Rückzugsmoränen, besonders am Mont Salève, fanden sich Siedlungen der jüngeren Altsteinzeit (Magdalénien), z. B. Veyrier. Während der Jungsteinzeit und der Bronzezeit, als der Wasserspiegel zeitweilig tiefer lag als heute, säumten den See zahlreiche Ufersiedlungen (Pfahlbauten). In keltischer und römischer Zeit waren Genf und Lausanne wichtige Hafenplätze.