Malkovich war Mitbegründer der »Steppenwolf Theatre Company«, in der er in den 1970/80er-Jahren Bühnenrollen übernahm und Regie führte. Seit den 1980er-Jahren ist er ein äußerst vielseitiger Filmdarsteller, u. a. in »Gefährliche Liebschaften« (1988) und »Von Mäusen und Menschen« (1992).